深圳车牌丢失后，车主可以通过以下步骤进行补办：
在线办理
通过“交管12123”手机App进行办理。下载并注册登录“交管12123”App，绑定个人名下机动车后，在首页点击“更多”进入“业务中心”，在“机动车业务”中选择“补换领机动车号牌”进行在线办理。
通过广东交通安全综合服务管理平台进行办理。登录交通安全综合服务管理平台（gd.122.gov.cn），绑定个人名下机动车，进入“业务办理”页面后，在“机动车业务”栏选择“补换领机动车号牌”业务进行在线办理。
窗口办理
车主先到车管分所填一张补领牌证申请表，公车要加盖单位公章后交给车管所。车管所将给车主一张警务回执单和一张临时牌照。临时牌照贴在车辆前风挡明显位置，以便民警查验。使用临时牌照不影响年检。如果车辆只丢失了一个牌照，在办理申请补领牌照手续时，需要把旧牌照交回。30个工作日以后，车主可以到车管所领取新牌照。
准备材料
《机动车牌证申请表》。
机动车所有人身份证明原件及复印件。
机动车登记证书原件及复印件。
《授权委托书》及代理人身份证明（由代理人代理申请的机动车登记和相关业务）。
车辆行驶证。
如果是单位的车辆车牌被盗，还需携带组织机构代码证。
建议车主优先选择在线办理方式，因为这种方式更加便捷且可以节省时间。如果选择窗口办理，需要提前准备好所有相关材料和手续。