关于迟到工资的扣除，以下是一些具体的规定和建议：
迟到扣款标准
一般规定：可以按照迟到或早退每分钟扣除一定金额的工资，例如每分钟10元，超过半小时则按旷工处理。
公司制度：有些公司规定迟到不超过30分钟每次扣20元，30分钟及以上每次扣50元，超过三小时且没有请假者按旷工处理。
累计迟到：每月迟到超过3次，从第4次开始每迟到1次视为旷工1天，员工每旷工1天，扣当月工资的8%。
法律依据
《中华人民共和国劳动法》：第五十条规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，用人单位不能随意罚款。
《工资支付暂行规定》：第七条规定工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付，迟到扣款应合理且符合法律规定。
扣除上限
每月扣除部分：用人单位扣除员工工资时，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
旷工处理
旷工罚款：旷工一天，员工需支付当日工资的双倍。
累计旷工：一月内旷工超过三天者，按自动离职处理。
注意事项
规章制度：用人单位在制定迟到扣款规章制度时，必须合法且合理，并且需要经过员工的同意或确认。
罚款权：普通用人单位不具有罚款权，罚款应视为扣发缺勤时间的工资。
建议
明确制度：用人单位应明确迟到扣款的具体规定，并通过合法程序制定相关规章制度。
合理扣款：扣款应合理且符合法律规定，避免因扣款过多而违反相关法规。
员工同意：在实施扣款前，应征得员工的同意，并在劳动合同或公司制度中明确约定。
透明度：扣款操作应透明，确保员工清楚了解扣款原因和依据。
通过以上规定和建议，用人单位可以在合理合法的前提下，对迟到的员工进行扣款处理。