申请食品QS认证（生产许可证）的流程如下：
准备申请材料
填写《食品生产许可证申请书》。
提供企业营业执照、食品卫生许可证、企业代码证（复印件）。
提供企业生产场所布局图、生产工艺流程图、各类质量管理文件、企业标准或国家标准备案。
提供必要的硬件设施证明，如化验室、更衣室、车间消毒设施、卫生间、防蚊蝇措施等。
提交申请
将准备好的申请材料提交至所在地的质量技术监督部门。
材料审核
质量技术监督部门首先对书面材料进行审查，如有不合格之处，会要求企业整改。
现场审核
审核通过后，质量技术监督局会安排审查组到现场进行审核，包括企业的必备条件和出厂检验能力。
现场审查合格的企业，审查组会现场抽封样品，并将样品送至指定的检测机构进行检测。
样品检测
检测机构对样品进行检测，并将检测结果反馈给质量技术监督部门。
审核与发证
质量技术监督部门根据审核报告和检测结果，确认企业符合发证条件后，会向上一级技术监督局提交相关资料并审核。
审核通过后，质量技术监督部门会向企业发放食品生产许可证及其副本。
换证与变更
生产许可证一般每三年换一次证，企业需要提前六个月向当地技术监督局提出换证申请。
当企业的食品原料、生产工艺、生产设备等发生重大改变时，需要进行生产许可证的变更，并及时提交相关申请。
建议：
企业在申请过程中应确保所有材料的真实性和完整性，并按照要求及时整改。
与当地技术监督部门保持良好沟通，确保申请流程顺利进行。
可以咨询专业的咨询公司或当地质监局，以获得更详细的指导和帮助。